در مجلس خبرگان قانون اساسی نماینده مردم یزد در این مجلس بود. وی بعد از اقامه نماز جمعه توسط عناصر سازمان مجاهدین خلق مشهور به منافقین به شهادت رسید. در ادبیات جمهوری اسلامی ایران آیت الله صدوقی یکی از شهدای محراب شمرده می‌شود. امام خمینی بعد از شهادت وی با صدور بیانیه‌ای وی را دوست سی ساله خود خواند. محمد علی صدوقی فرزند وی بعدها امامت جمعه یزد را بر عهده گرفت.